1885年步兵第10旅团长，1887年5月23日封男爵；1888年5月14日任第二师团首任师团长，甲午中日战争开始的时候在广岛大本营，后来在大山岩元帅的第二军编成内参加攻占威海卫，消灭了北洋舰队。

1895年4月5日就任占领地总督，8月20日升子爵；回国后历任近卫师团长，中部都督；1898年9月28日晋升陆军大将，1902年休职；1904年五月，日俄战争时出任东京卫戍总督；因为佐久间曾经参与对远征台湾的牡丹社事件，日本遂决定启用他担任总督；接替即将担任满洲军参谋总长的儿玉源太郎为第5任台湾总督（1906-1915），授予勋一等旭日桐花大绶章；1907年9月21日升伯爵，其在任期间，在后藤新平的帮助下；积极镇压汉人之反抗，自北埔蔡清琳、罗福星、张火炉，以及林老才；至少镇压了十次抗日事件，佐久间左马太对台湾人民的血腥镇压的行为，可以算得上是侵华战犯；日本占领台湾以后，台湾全岛的汉人抗日活动在一段时间后逐渐趋于平息；日本政府遂将目光转向理番事业，并且决定采用武装镇压的手段来对付原住民。

佐久间在任内不断地对原住民用兵，其有名的“五年理蕃计画“，以北讨泰雅族；南抚布农族为原则，扩张隘勇线，且架设高压电铁丝网、埋设触发性地雷及电气地雷以围堵蕃界。更亲自督军讨伐大嵙崁、北势番、马利可宛、奇那济、太鲁阁诸蕃，其中最有名就是“太鲁阁“之役（大正3年，1914年），总部就设于石门山山下。他把全岛共分十二区作战，动员军警一万余人，以血腥手段强力镇压原住民之反抗。在行政方面，他于1909年将全岛二十厅政区并合为十二厅，并以其面积及财经地位之轻重分为三等级，其中台北、台中、台南为一等厅，新竹、嘉义、阿猴（屏东）为二等厅，其余宜兰、桃园、南投、台东、花莲港、澎湖均为三等厅。而为搜括台湾资源，积极进行产业开发，大肆扩建基隆港与高雄港，辟建阿里山森林铁道以利林木之采伐和运输。

此外，他更积极移置宗主国的日本农民来台，以期增加日人之比率以有效控制本岛，乃在花莲港厅和台东厅两地汉人较少的地方开辟吉野、丰田、林田、旭、鹿野、鹿寮、敷岛等许多「日本村」，移入数千位日本农民。当理番事业告一段落之后，随即卸下总督职务。是台湾总督中在任最久的一个

卸任后返日未久，就在1915年8月5日去世，年七十二。

但是今天他却是发梦也想不到的是他会提前死掉，而且还是死在自己的同胞枪下。

在水野良田他们快速地急行军，进行包抄总督府时，

佐久间左马太还在一边做着各种各样地爱情动作片，一边用各种各样变态地手段在遭塌着他身下的那两个，没有任何衣服穿着的年仅15岁的女孩。

“爽！实在是太爽！太舒服了！支那女孩真是让人舒服的不行，不行的！”佐久间左马太疯狂地做着活塞动作赞赏道。

“呜呜呜！不要！不要！啊！慢点，慢点！呜呜呜！”

而他身下的那个15岁左右的女孩，则是痛苦地哭泣求饶着。

“叫吧！叫的越大声！我越喜欢！哈哈哈！尽情地叫吧！支那女孩！这里是不会有任何人来救你们的!”佐久间左马太仿佛疯子一般疯狂地哈哈大笑道。

“呜呜呜！救命！救命啊！爸爸！妈妈！”15岁左右的女孩拼命地哭泣着求救道。

“哈哈哈！爽啊！********！叫吧！再大声一点地叫吧！支那女孩！叫死了也没有人来救你的！”

可惜，不管女孩如何喊叫，或者是痛苦地哀嚎，惨叫，回应她的还是佐久间左马太，那没有任何怜悯，任何善意的疯狂笑声，以及更加疯狂地继续遭塌着她和另一个女孩。