九月二十八日，古北口提督赵国华、马兰镇总兵蒋义、泰宁镇总兵胡伟、宣化镇总兵杜子飞被诱杀于北京，所部提标四营，镇标七营，并遵化协营、紫荆关一标经裁撤整编，合编为关宁军混成第三师团，师团长马龙，计四个联队，战兵一万二千人。【】

九月二十九日，天津镇总兵周保亮、大名镇总兵斐大刚、通永镇总兵华云国于保定被杀，三将所辖镇标八营、河间、大沽二协，固关营兵、开州一协、大名城守营、山永二协兵改编为关宁军混成第四师团，师团隶属直隶巡抚齐壮直辖，有兵一万一千人。直隶原提督金国正所部绿营兵七千人改建直隶各府县守备兵，归属地方各府县直领。

九月三十日，康熙自盛京经锦州回师山海关，与岳乐所部兵马会合，计有兵员五万。当日即由康亲王杰督所部一万兵强行攻关，遗尸三千余具于关下，未克。双方陷入僵持阶段，清军力进攻，关宁军也意出关决战。只使人向关下射出布告，曰宣统皇帝已登基，康熙已死于盛京，拒不承认康熙仍活着事实。

十月初二，京师邻郊各府县绿营兵及新征兵两万五千人开赴山海关，编为关宁军混成第五师团，师团长伍枫秋。至此，集于山海关的关宁军兵力压倒清军。

十月初五，南怀仁督造完成36门开花炮运至山海关下。

十月初七，康熙闻知盛京遭清原关宁攻击，葛尔丹已破科尔沁，越过黑山向锦州进犯，唯恐后路被退，成瓮之鳖，不顾将疲兵丧，强令再攻山海关。激战一日，弃尸万余，仍不得入关内一步。

十月初八日，关宁军遣密使与清简亲王雅布、肃亲王富绶密商，以杀康熙者为关外王的条件，诱使雅布与富绶作乱。不料事泄，康熙先下手为强，以召御营会议为名，暗埋伏侍卫乱刀砍杀雅布、富绶，诛杀二王部下三十余名将领，接管二人名下兵马。

十月初九，久攻不下且有断粮之危，康熙领残军三万余连夜往盛京逃去，赵强领五万兵马尾随其后。

十月十四，关宁军完成对盛京包围，偏师占领辽西等地，断了康熙由海路逃至关内之念。

十月十六日，葛尔丹率准葛尔兵与关宁军会师盛京城下，双方约定先入盛京者即拥有此城。

十月二十八日，盛京将军赖塔领兵突围，因后继不支，败回城。

十一月初三，葛尔丹挥师攻城，未克，后不再强行攻城，留一万兵于盛京，自带主力回返漠南，以消灭漠南残余各部。

十一月初六，赵强遣使要康熙投降，可保证城内旗人性命。康熙不允，斩杀使者。赵强大怒，开挖福陵、昭陵，掘努尔哈赤与皇太极之尸以白布系之，悬于军营辕门之。清军闻之，举城哀嚎。

十一月初八，城内断粮。十四日，斩杀军马充饥。二十四日，杀人为食。

宣统二年二月初九，康熙自感回天之力，服毒自杀。康亲王杰领盛京大小官员开城投降。